北京妇产医院妇科由著名妇产科专家林巧稚创建，是医院建院时成立的支柱科室。我院妇科系统2010年成为卫生部临床重点建设专科。
建院以来，在一代代妇科人的不懈努力下，妇科现已发展成为专业技术实力雄厚，梯队化管理严谨，各类专业技术人才齐备的特色科室。在各类妇科良性及恶性疾病的诊治方面，具有扎实的理论基础、丰富的临床经验以及熟练的手术技巧。妇科年门诊量17万余人次，接收来自全国各地的各种妇产科疑难重症患者达50%以上。
几十年来，妇科在传承各种传统手术的基础上，开展以微创为前提的妇科手术治疗体系，广泛地采用腹腔镜、宫腔镜、阴道镜等妇科内镜技术，年腔镜手术量5000余人次，其中50%以上为四级妇科内镜手术。盆腔器官脱垂的手术及康复治疗、特色的青少年妇科、复杂生殖道畸形矫治、盆底组织损伤后修复整形、子宫内膜异位症综合管理及妇科恶性肿瘤手术及综合治疗均居国内领先水平。
2018年妇科成立亚洲第一个“欧洲认证的国际跨学科子宫内膜异位症中心”。2014年成立北京市盆底功能障碍性疾病诊治中心及盆底康复技术培训中心，经过10余年的发展，取得了显著成效。2019年4月与法国尼姆大学附属中心医院合作成立“中法整体康复技术合作中心”，技术与国际前沿接轨，确立了妇科在国内学术界的地位及威望。
2019年4月挂牌成为“中国女性微生态诊治中心”，确立了妇科在女性感染性疾病诊治方面的学术地位。
妇科现有博士生导师2名，硕士生导师2名，高级职称35名、中级职称医师12名。承担着首都医科大学博士生、硕士生以及北京市基层学科骨干的培养及临床带教任务，同时，也是培养年轻医师、进修医师的专业化基地。
妇科承担国家自然科学基金课题；国家十一五攻关课题；十二五国家科技支撑课题；北京市首发重点攻关课题；北京市科委首都特色课题及培育课题；北京市优秀人才基金；留学归国人员课题等多项科研项目。曾获得全国妇幼健康科学技术奖、北京市科技进步奖等奖项。举办多个品牌的国家级继续教育项目，已连续十三届成功举办《妇科热点问题新进展研讨班》，连续十六届成功举办《中华医学会女性生殖道感染峰会》，每年两期《女性盆腔器官脱垂手把手培训班》，培养学员遍及全国各地，获得良好的口碑，成为妇科的品牌继续教育项目。
